Esta es una lista de habitaciones de Metroid Prime. Están ordenadas por zona.
Fragata Orpheon[]
- Hangar de Atraque Exterior
- Esclusa
- Área de Evacuación de Emergencia
- Área 1 de Investigación Biotecnológica
- Contenedor de Riesgo Biológico
- Área 2 de Investigación Biotecnológica
- Núcleo del Reactor
- Entrada al Núcleo del Reactor
- Conducto de la Cubierta Beta
- Acceso de la Cubierta Alfa
- Conducto Umbilical de la Cubierta Alfa
- Estación del Mapa
- Ascensor de Interconexión de la Cubierta Beta 1
- Ascensor de Interconexión de la Cubierta Beta 2
- Sala de Seguridad de la Cubierta Beta
- Sala de Tránsito de la Cubierta Beta
- Ascensor de Carga de la Cubierta Gamma
- Sala de Monitoreo de la Cubierta Gamma
- Sector A del Sistema de Subventilación
- Sector B del Sistema de Subventilación
- Sector A del Sistema de Ventilación
- Sector B del Sistema de Ventilación
- Sector C del Sistema de Ventilación
- Sector D del Sistema de Ventilación
- Sector E del Sistema de Ventilación
- Sector F del Sistema de Ventilación
- Ascensor de Interconexión de la Cubierta Alfa
- Sector Mecánico de la Cubierta Alfa
Superficie de Tallon[]
- Lugar del Aterrizaje
- Cañón de Tallon
- Templo de los Artefactos
- Barranco
- Arboleda
- Cueva de las Raíces
- Lugar del Impacto de la Fragata
- Sala del Gran Árbol
- Túnel de la Arboleda
- Caverna de la Cascada
- Caverna del Cañón
- Cámara del Gran Árbol
- Contenedor de Riesgo Biológico
- Caverna Poblada
- Túnel del Ascensor A
- Túnel del Ascensor B
- Túnel del Ascensor C
- Túnel del Ascensor D
- Túnel del Ascensor E
- Ascensor hacia el Oeste de las Ruinas Chozo
- Ascensor hacia el Este de las Ruinas Chozo
- Ascensor hacia el Sur de las Ruinas Chozo
- Ascensor hacia el Este de las Cavernas Magmoor
- Ascensor hacia el Este de las Minas de Phazon
- Sala del Templo
- Estación de Seguridad del Templo
- Vestíbulo del Templo
- Túnel en las Raíces
- Nicho
- Túnel de Acceso a la Fragata
- Sector C del Sistema de Ventilación
- Sector B del Sistema de Ventilación
- Sector A del Sistema de Ventilación
- Núcleo del Reactor
- Estación de Guardado
- Acceso al Reactor
- Ascensor de Carga de la Cubierta Gamma
- Sala de Tránsito de la Cubierta Beta
- Sala de Seguridad de la Cubierta Beta
- Área 1 de Investigación Biotecnológica
- Conducto de la Cubierta Beta
- Ascensor de Interconexión de la Cubierta Beta 1
- Túnel Acuático de Acceso
- Cámara del Cenador
Ruinas Chozo[]
- Ascensor hacia el Norte de la Superficie de Tallon
- Entrada a las Ruinas
- Plaza Principal
- Acceso al Vivero
- Túnel Eyon
- Vivero en Ruinas
- Estación de Guardado 1
- Atrio Norte
- Galería en Ruinas
- Estación del Mapa
- Acceso al Tótem
- Nido-Tótem
- Acceso del Ascensor Norte
- Acceso al Sepulcro en Ruinas
- Cúpula en Ruinas
- Acceso a la Fuente en Ruinas
- Fuente en Ruinas
- Fuente de la Meditación
- Acceso al Arboreto
- Arboreto
- Vestíbulo de la Cámara Solar
- Acceso a la Cámara Solar
- Cámara Solar
- Acceso a la Torre Solar
- Torre Solar
- Ascensor hacia el Norte de las Cavernas Magmoor
- Acceso al Panteón
- Panteón
- Acceso a la Plaza
- Acceso a la Sala de Reunión
- Sala de Reunión
- Estación de Guardado 2
- Acceso al Pasillo Acuático
- Pasillo Acuático
- Atrio Este
- Acceso al Núcleo de Energía
- Núcleo de Energía
- Acceso a la Cúpula Ardiente
- Cúpula Ardiente
- Acceso al Horno Oeste
- Horno
- Torre de la Luz
- Cámara de la Torre
- Cámara de los Ancianos
- Cámara de Entrenamiento
- Cruce
- Sala de los Ancianos
- Lago Reflectante
- Antecámara
- Lago de Magma
- Dinamo
- Acceso a la Cámara de Entrenamiento
- Acceso del Ascensor Sur
- Acceso a la Dinamo
- Acceso a la Torre de Luz
- Acceso al Cruce Oeste
- Acceso al Cruce Sur
- Acceso a la Sala de los Ancianos
- Acceso al Lago Reflectante
- Túnel del Émbolo
- Ascensor hacia el Este de la Superficie de Tallon
- Ascensor hacia el Sur de la Superficie de Tallon
- Estación de Guardado 3
Cavernas Magmoor[]
- Ascensor hacia el Norte de las Ruinas Chozo
- Sendero de Magma
- Estación de Guardado A
- Túnel del Lago
- Lago de Lava
- Túnel del Pozo
- Pozo de Triclops
- Caverna de Almacenamiento
- Túnel de Control
- Estación de Control
- Sepulcro del Guerrero
- Túnel del Ascensor A
- Ascensor hacia el Norte de Phendrana
- Túnel de Costa
- Orillas de Fuego
- Túnel del Ascensor B
- Ascensor hacia el Oeste de la Superficie de Tallon
- Túnel de los Fuegos Gemelos
- Estación de Trabajo de Magmoor
- Túnel de la Estación de Trabajo
- Núcleo Geotérmico
- Procesamiento de Plasma
- Ascensor hacia el Sur de Phendrana
- Ascensor hacia el Oeste de las Minas de Phazon
- Fuegos Gemelos
- Túnel del Núcleo Norte
- Túnel del Núcleo Sur
- Estación de Guardado B
- Túnel del Ascensor C
Phendrana[]
- Orillas de Phendrana
- Cámara Gravitatoria
- Este de las Ruinas de Hielo
- Área Desolada
- Oeste de las Ruinas de Hielo
- Cañón de Phendrana
- Capilla de los Ancianos
- Torre de Control
- Templo de Hielo Chozo
- Cueva de Almacenamiento
- Laboratorio de Investigación Hidra
- Observatorio
- Laboratorio de Investigación Éter
- Centro del Área de Investigación
- Pico Nevado
- Cueva del Cazador
- Cueva Congelada
- Límites de Phendrana
- Cueva de Cuarentena
- Control de Cuarentena
- Cueva de Seguridad
- Camino al Ascensor
- Ascensor hacia el Oeste de las Cavernas Magmoor
- Ascensor hacia el Sur de las Cavernas Magmoor
- Acceso a las Ruinas de Hielo
- Pasaje Superior
- Entrada de las Orillas
- Entrada de las Ruinas
- Entrada al Templo
- Túnel de la Capilla
- Estación de Guardado A
- Estación de Guardado B
- Estación de Guardado C
- Estación de Guardado D
- Entrada del Cañón
- Entrada al Área Desolada
- Acceso a la Cuarentena
- Túnel Norte de la Cueva de Cuarentena
- Túnel Sur de la Cueva de Cuarentena
- Almacenamiento de Especímenes
- Entrada al Área de Investigación
- Estación del Mapa
- Entrada al Laboratorio de Investigación Hidra
- Acceso al Observatorio
- Entrada a la Torre Oeste
- Torre Oeste
- Torre Este
- Entrada al Laboratorio de Investigación Éter
- Acceso al Centro del Área de Investigación
- Acceso al Pico Nevado
- Acceso a la Cueva del Cazador
- Pasadizo a la Cueva Congelada
- Túnel del Lago
- Acceso a la Cámara
- Túnel Superior de los Límites
- Túnel Inferior de los Límites
Minas de Phazon[]
- Cantera Principal
- Acceso al Cuartel de Élite
- Cuartel de Élite
- Laboratorio Élite
- Minería de Phazon
- Procesamiento del Mineral
- Control de Élite
- Compartimento de Ventilación
- Dinamo Central
- Laboratorio Omega
- Estación de Seguridad de la Mina
- Sala de Hongos A
- Sala de Hongos B
- Cuarentena de Metroides A
- Cuarentena de Metroides B
- Centro de Procesamiento del Phazon
- Acceso A a la Cuarentena
- Acceso B a la Cuarentena
- Acceso al Ascensor A
- Acceso al Ascensor B
- Ascensor A
- Ascensor B
- Acceso a la Sala de Hongos
- Depósito de Almacenamiento A
- Depósito de Almacenamiento B
- Acceso al Laboratorio
- Acceso al Control de Élite
- Acceso a la Dinamo
- Tratamiento de Residuos
- Acceso de Seguridad A
- Acceso de Seguridad B
- Acceso al Centro de Procesamiento
- Acceso al Ascensor
- Ascensor hacia el Sur de la Superficie de Tallon
- Ascensor hacia el Sur de las Cavernas Magmoor
- Estación de Guardado A
- Estación de Guardado B
- Estación de Guardado C
- Acceso a la Cantera
- Estación del Mapa de las Minas
- Estación de Misiles de las Minas
- Túnel de Mantenimiento
Cráter del Impacto[]
- Túnel C del Cráter
- Túnel A del Cráter
- Núcleo del Phazon
- Estación de Misiles del Cráter
- Túnel B del Cráter
- Cámara de Phazon
- Subcámara 1
- Subcámara 2
- Subcámara 3
- Subcámara 4
- Subcámara 5
- Guarida del Metroid Prime