Metroid Prime: Hunters (メトロイドプライム ハンターズ) est un jeu vidéo d'action-aventure/FPS développé et édité par Nintendo sur Nintendo DS. Il est sorti le 21 mars 2006 au Japon et le 5 mai 2006 en Europe. Le jeu est également disponible en téléchargement via la Wii U Virtual Console depuis le 30 septembre 2015 au Japon.
Ce volet opte pour une orientation résolument action avec notamment l'ajout d'un mode multijoueur en ligne jouable jusqu'à quatre simultanément ainsi que la possibilité de profiter des fonctionnalités du micro de la console afin de communiquer avec tout autre joueur présent lors d'une partie. Le jeu est compatible avec la Cartouche Vibration DS (NDS Rumble Pak).